Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms