Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFMP07197 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFMP07197 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFMP07197 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFMP07197 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFMP07197 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFMP07197 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFMP07197 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFMP07197 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFMP07197 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFMP07197 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFMP07197 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEFMP07197 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEFMP07197 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NEFMP07197 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEFMP07197 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEFMP07197 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NEFMP07197 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEFMP07197 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEFMP07197 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEFMP07197 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEFMP07197 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEFMP07197 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEFMP07197 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEFMP07197 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEFMP07197 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEFMP07197 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEFMP07197 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEFMP07197 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEFMP07197 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEFMP07197 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEFMP07197 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEFMP07197 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEFMP07197 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEFMP07197 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEFMP07197 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEFMP07197 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEFMP07197 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEFMP07197 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEFMP07197 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEFMP07197 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEFMP07197 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEFMP07197 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEFMP07197 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEFMP07197 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEFMP07197 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEFMP07197 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFMP07197 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFMP07197 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFMP07197 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFMP07197 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFMP07197 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFMP07197 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFMP07197 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFMP07197 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFMP07197 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFMP07197 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFMP07197 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFMP07197 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFMP07197 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFMP07197 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFMP07197 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFMP07197 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFMP07197 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFMP07197 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFMP07197 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFMP07197 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFMP07197 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFMP07197 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFMP07197 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFMP07197 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFMP07197 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFMP07197 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFMP07197 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFMP07197 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFMP07197 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFMP07197 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFMP07197 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFMP07197 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFMP07197 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFMP07197 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFMP07197 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFMP07197 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFMP07197 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFMP07197 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFMP07197 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFMP07197 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFMP07197 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFMP07197 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFMP07197 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFMP07197 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFMP07197 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFMP07197 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFMP07197 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFMP07197 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFMP07197 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFMP07197 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFMP07197 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFMP07197 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFMP07197 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms