Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB2P05107 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB2P05107 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB2P05107 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB2P05107 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB2P05107 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB2P05107 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB2P05107 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB2P05107 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB2P05107 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB2P05107 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB2P05107 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB2P05107 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB2P05107 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB2P05107 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB2P05107 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB2P05107 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB2P05107 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms