Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TYMSP04818 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TYMSP04818 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TYMSP04818 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TYMSP04818 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TYMSP04818 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TYMSP04818 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TYMSP04818 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TYMSP04818 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TYMSP04818 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TYMSP04818 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TYMSP04818 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TYMSP04818 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TYMSP04818 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TYMSP04818 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TYMSP04818 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TYMSP04818 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TYMSP04818 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TYMSP04818 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TYMSP04818 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TYMSP04818 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TYMSP04818 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TYMSP04818 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TYMSP04818 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TYMSP04818 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TYMSP04818 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TYMSP04818 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TYMSP04818 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TYMSP04818 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TYMSP04818 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TYMSP04818 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TYMSP04818 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TYMSP04818 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TYMSP04818 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TYMSP04818 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TYMSP04818 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TYMSP04818 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TYMSP04818 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TYMSP04818 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TYMSP04818 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TYMSP04818 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TYMSP04818 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TYMSP04818 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TYMSP04818 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TYMSP04818 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TYMSP04818 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TYMSP04818 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TYMSP04818 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TYMSP04818 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TYMSP04818 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TYMSP04818 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TYMSP04818 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TYMSP04818 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TYMSP04818 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TYMSP04818 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TYMSP04818 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TYMSP04818 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms