Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP19O94966 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP19O94966 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP19O94966 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP19O94966 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP19O94966 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP19O94966 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP19O94966 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP19O94966 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP19O94966 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP19O94966 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP19O94966 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP19O94966 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP19O94966 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP19O94966 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
USP19O94966 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP19O94966 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP19O94966 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP19O94966 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
USP19O94966 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP19O94966 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP19O94966 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP19O94966 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
USP19O94966 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
USP19O94966 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
USP19O94966 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP19O94966 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
USP19O94966 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP19O94966 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP19O94966 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP19O94966 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP19O94966 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP19O94966 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP19O94966 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP19O94966 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP19O94966 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP19O94966 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP19O94966 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP19O94966 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP19O94966 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP19O94966 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP19O94966 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP19O94966 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP19O94966 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP19O94966 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
USP19O94966 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP19O94966 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP19O94966 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP19O94966 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP19O94966 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP19O94966 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP19O94966 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP19O94966 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP19O94966 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP19O94966 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP19O94966 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP19O94966 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP19O94966 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP19O94966 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP19O94966 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
USP19O94966 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP19O94966 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP19O94966 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP19O94966 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP19O94966 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP19O94966 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP19O94966 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP19O94966 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP19O94966 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP19O94966 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
USP19O94966 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP19O94966 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP19O94966 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP19O94966 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP19O94966 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP19O94966 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP19O94966 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP19O94966 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP19O94966 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
USP19O94966 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP19O94966 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP19O94966 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP19O94966 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP19O94966 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP19O94966 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP19O94966 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP19O94966 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP19O94966 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP19O94966 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP19O94966 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP19O94966 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP19O94966 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP19O94966 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP19O94966 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP19O94966 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP19O94966 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP19O94966 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP19O94966 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP19O94966 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP19O94966 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms