Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STX6O43752 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX6O43752 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX6O43752 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX6O43752 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STX6O43752 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX6O43752 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX6O43752 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX6O43752 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STX6O43752 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STX6O43752 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX6O43752 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX6O43752 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX6O43752 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX6O43752 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX6O43752 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX6O43752 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX6O43752 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX6O43752 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX6O43752 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX6O43752 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX6O43752 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX6O43752 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX6O43752 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX6O43752 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX6O43752 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX6O43752 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX6O43752 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX6O43752 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STX6O43752 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX6O43752 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX6O43752 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX6O43752 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX6O43752 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX6O43752 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX6O43752 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX6O43752 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX6O43752 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX6O43752 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX6O43752 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX6O43752 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX6O43752 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX6O43752 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX6O43752 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX6O43752 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX6O43752 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX6O43752 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX6O43752 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX6O43752 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX6O43752 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX6O43752 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX6O43752 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX6O43752 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX6O43752 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX6O43752 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX6O43752 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX6O43752 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX6O43752 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
STX6O43752 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX6O43752 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX6O43752 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX6O43752 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
STX6O43752 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX6O43752 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX6O43752 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
STX6O43752 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX6O43752 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX6O43752 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX6O43752 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX6O43752 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX6O43752 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
STX6O43752 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX6O43752 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX6O43752 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX6O43752 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX6O43752 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX6O43752 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
STX6O43752 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX6O43752 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX6O43752 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX6O43752 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX6O43752 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX6O43752 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
STX6O43752 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX6O43752 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX6O43752 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
STX6O43752 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
STX6O43752 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX6O43752 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
STX6O43752 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX6O43752 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX6O43752 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX6O43752 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX6O43752 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX6O43752 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX6O43752 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX6O43752 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX6O43752 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX6O43752 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX6O43752 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms