Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNQ2O43526 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
KCNQ2O43526 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNQ2O43526 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNQ2O43526 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNQ2O43526 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNQ2O43526 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNQ2O43526 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNQ2O43526 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNQ2O43526 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNQ2O43526 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNQ2O43526 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNQ2O43526 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNQ2O43526 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNQ2O43526 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNQ2O43526 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNQ2O43526 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNQ2O43526 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNQ2O43526 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms