Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCAO15360 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCAO15360 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCAO15360 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCAO15360 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCAO15360 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCAO15360 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCAO15360 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCAO15360 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCAO15360 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCAO15360 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCAO15360 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FANCAO15360 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FANCAO15360 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FANCAO15360 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FANCAO15360 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FANCAO15360 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FANCAO15360 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FANCAO15360 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FANCAO15360 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FANCAO15360 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FANCAO15360 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
FANCAO15360 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
FANCAO15360 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FANCAO15360 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FANCAO15360 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FANCAO15360 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FANCAO15360 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FANCAO15360 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FANCAO15360 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FANCAO15360 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
FANCAO15360 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FANCAO15360 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
FANCAO15360 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FANCAO15360 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FANCAO15360 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FANCAO15360 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FANCAO15360 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FANCAO15360 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FANCAO15360 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FANCAO15360 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FANCAO15360 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FANCAO15360 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FANCAO15360 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FANCAO15360 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FANCAO15360 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FANCAO15360 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
FANCAO15360 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
FANCAO15360 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
FANCAO15360 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FANCAO15360 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FANCAO15360 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FANCAO15360 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
FANCAO15360 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FANCAO15360 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FANCAO15360 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FANCAO15360 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FANCAO15360 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FANCAO15360 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FANCAO15360 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FANCAO15360 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FANCAO15360 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FANCAO15360 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FANCAO15360 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FANCAO15360 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FANCAO15360 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FANCAO15360 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FANCAO15360 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FANCAO15360 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FANCAO15360 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FANCAO15360 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FANCAO15360 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FANCAO15360 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FANCAO15360 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
FANCAO15360 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FANCAO15360 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FANCAO15360 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FANCAO15360 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FANCAO15360 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FANCAO15360 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FANCAO15360 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FANCAO15360 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FANCAO15360 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FANCAO15360 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FANCAO15360 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FANCAO15360 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FANCAO15360 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FANCAO15360 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FANCAO15360 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FANCAO15360 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FANCAO15360 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FANCAO15360 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FANCAO15360 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FANCAO15360 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FANCAO15360 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FANCAO15360 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FANCAO15360 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FANCAO15360 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FANCAO15360 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FANCAO15360 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms