Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SETD1AO15047 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SETD1AO15047 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SETD1AO15047 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SETD1AO15047 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SETD1AO15047 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SETD1AO15047 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SETD1AO15047 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SETD1AO15047 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SETD1AO15047 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SETD1AO15047 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SETD1AO15047 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SETD1AO15047 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SETD1AO15047 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SETD1AO15047 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SETD1AO15047 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SETD1AO15047 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SETD1AO15047 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SETD1AO15047 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SETD1AO15047 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SETD1AO15047 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SETD1AO15047 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SETD1AO15047 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SETD1AO15047 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SETD1AO15047 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SETD1AO15047 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SETD1AO15047 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms