Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOCS6O14544 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms