Protein–RNA interactions for Protein: O00512

BCL9, B-cell CLL/lymphoma 9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL9O00512 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BCL9O00512 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BCL9O00512 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
BCL9O00512 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BCL9O00512 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BCL9O00512 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BCL9O00512 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BCL9O00512 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BCL9O00512 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BCL9O00512 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BCL9O00512 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BCL9O00512 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
BCL9O00512 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BCL9O00512 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BCL9O00512 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BCL9O00512 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BCL9O00512 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BCL9O00512 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL9O00512 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL9O00512 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL9O00512 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL9O00512 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL9O00512 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL9O00512 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL9O00512 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL9O00512 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL9O00512 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL9O00512 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL9O00512 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL9O00512 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL9O00512 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL9O00512 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL9O00512 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL9O00512 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCL9O00512 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCL9O00512 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCL9O00512 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCL9O00512 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCL9O00512 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCL9O00512 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCL9O00512 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCL9O00512 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCL9O00512 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCL9O00512 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BCL9O00512 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCL9O00512 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCL9O00512 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCL9O00512 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCL9O00512 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCL9O00512 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BCL9O00512 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCL9O00512 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCL9O00512 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCL9O00512 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCL9O00512 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BCL9O00512 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCL9O00512 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCL9O00512 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BCL9O00512 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCL9O00512 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCL9O00512 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCL9O00512 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCL9O00512 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCL9O00512 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCL9O00512 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCL9O00512 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL9O00512 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL9O00512 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL9O00512 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL9O00512 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL9O00512 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL9O00512 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL9O00512 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL9O00512 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL9O00512 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL9O00512 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL9O00512 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BCL9O00512 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BCL9O00512 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BCL9O00512 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BCL9O00512 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BCL9O00512 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BCL9O00512 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BCL9O00512 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BCL9O00512 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BCL9O00512 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BCL9O00512 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL9O00512 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL9O00512 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL9O00512 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL9O00512 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL9O00512 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL9O00512 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL9O00512 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL9O00512 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL9O00512 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL9O00512 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL9O00512 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL9O00512 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL9O00512 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms