Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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