Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms