Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC9

SH2D7, SH2 domain-containing protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D7A6NKC9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms