Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms