Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms