Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SAMD8Q96LT4 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms