Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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RAB39AQ14964 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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RAB39AQ14964 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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RAB39AQ14964 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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RAB39AQ14964 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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RAB39AQ14964 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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RAB39AQ14964 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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RAB39AQ14964 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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RAB39AQ14964 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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RAB39AQ14964 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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RAB39AQ14964 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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RAB39AQ14964 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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RAB39AQ14964 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RAB39AQ14964 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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