Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
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CHD4Q14839 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
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CHD4Q14839 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.74
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CHD4Q14839 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
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CHD4Q14839 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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