Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
E2F1Q01094 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms