Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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RPE65Q16518 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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RPE65Q16518 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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RPE65Q16518 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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RPE65Q16518 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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RPE65Q16518 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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