Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 SCN8A-203ENST00000545061 11433 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 NIPBL-202ENST00000448238 8729 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 RAB21-201ENST00000261263 15546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
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