Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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SS18Q15532 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SS18Q15532 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SS18Q15532 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SS18Q15532 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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