Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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FOXE3Q13461 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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FOXE3Q13461 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
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FOXE3Q13461 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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FOXE3Q13461 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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FOXE3Q13461 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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FOXE3Q13461 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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FOXE3Q13461 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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