Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 LINC00269-201ENST00000399711 2173 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 YES1-201ENST00000314574 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 ACTA2-AS1-201ENST00000437930 2450 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 ZNF844-202ENST00000441304 2036 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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