Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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PTPRMP28827 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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PTPRMP28827 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
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PTPRMP28827 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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PTPRMP28827 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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PTPRMP28827 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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