Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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