Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms