Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNTA1Q13424 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms