Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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