Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOSBP53539 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOSBP53539 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOSBP53539 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOSBP53539 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOSBP53539 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOSBP53539 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOSBP53539 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOSBP53539 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOSBP53539 LRRC37A12P-201ENST00000454917 1801 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOSBP53539 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOSBP53539 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOSBP53539 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOSBP53539 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOSBP53539 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOSBP53539 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOSBP53539 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOSBP53539 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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FOSBP53539 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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FOSBP53539 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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FOSBP53539 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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FOSBP53539 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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FOSBP53539 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOSBP53539 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
FOSBP53539 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
FOSBP53539 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
FOSBP53539 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
FOSBP53539 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
FOSBP53539 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
FOSBP53539 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
FOSBP53539 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
FOSBP53539 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
FOSBP53539 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
FOSBP53539 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
FOSBP53539 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
FOSBP53539 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
FOSBP53539 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
FOSBP53539 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
FOSBP53539 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
FOSBP53539 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
FOSBP53539 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
FOSBP53539 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
FOSBP53539 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
FOSBP53539 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
FOSBP53539 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
FOSBP53539 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
FOSBP53539 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
FOSBP53539 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
FOSBP53539 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
FOSBP53539 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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