Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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HOXD12P35452 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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HOXD12P35452 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXD12P35452 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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