Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HLA-DQB1P01920 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
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