Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRRQ15256 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRRQ15256 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRRQ15256 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRRQ15256 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRRQ15256 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRRQ15256 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRRQ15256 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRRQ15256 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRRQ15256 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRRQ15256 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRRQ15256 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms