Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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