Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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