Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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PTPRMP28827 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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