Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 MEIS1-202ENST00000398506 3530 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPREP23469 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPREP23469 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPREP23469 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPREP23469 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPREP23469 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPREP23469 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPREP23469 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPREP23469 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPREP23469 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPREP23469 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPREP23469 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPREP23469 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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PTPREP23469 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPREP23469 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPREP23469 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPREP23469 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPREP23469 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPREP23469 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPREP23469 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPREP23469 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPREP23469 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPREP23469 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPREP23469 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPREP23469 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPREP23469 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPREP23469 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPREP23469 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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