Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 MOB1A-201ENST00000396049 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO18A-214ENST00000533112 7522 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ERBB2-218ENST00000584450 3730 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC8E-206ENST00000618098 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01694-202ENST00000441095 6721 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP2-214ENST00000543010 3576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD13C-202ENST00000370944 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAPPC9-202ENST00000438773 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 WFS1-201ENST00000226760 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 METTL22-202ENST00000381920 4984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PITX2-213ENST00000616641 3102 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 STRC-213ENST00000541030 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SHMT2-205ENST00000553474 1765 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NUTM2A-201ENST00000381689 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NBN-201ENST00000265433 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LIN37-201ENST00000301159 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR135B-201ENST00000362189 97 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU12-201ENST00000362512 150 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP379-201ENST00000364599 113 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 OBP2B-202ENST00000372034 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM91-204ENST00000413014 650 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092418.1-201ENST00000415328 623 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 FAHD2CP-201ENST00000427863 900 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC016894.1-201ENST00000444364 311 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL380P-201ENST00000461702 308 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL675P-201ENST00000478498 297 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL278P-201ENST00000488843 296 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC025171.2-202ENST00000505541 402 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLV2-5-201ENST00000522922 277 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 BMF-210ENST00000561360 735 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008750.6-201ENST00000598746 322 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 uc_338.33-201ENST00000614988 170 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.154-201ENST00000615469 268 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6770-3-201ENST00000616362 60 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6770-2-201ENST00000618304 60 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6770-1-201ENST00000622248 60 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AL355480.3-201ENST00000630128 96 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 WASH5P-209ENST00000633742 173 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC016582.3-206ENST00000636547 207 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SERPINA1-206ENST00000437397 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 HNF1A-208ENST00000541395 3332 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 IL10RA-201ENST00000227752 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SMOC1-202ENST00000381280 3666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PXN-204ENST00000424649 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AAGAB-201ENST00000261880 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF10L-204ENST00000375415 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR179-204ENST00000621958 7983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP7D3-203ENST00000370661 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 EHF-201ENST00000257831 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 FCRL3-201ENST00000368184 4725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 FNDC3B-202ENST00000415807 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MAST4-201ENST00000261569 7664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LVRN-201ENST00000357872 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHM1-201ENST00000430334 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01164-201ENST00000341866 3384 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR6-207ENST00000448293 3377 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CYCS-201ENST00000305786 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.9 ms