Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL121721.1-201ENST00000460400 568 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RN7SL19P-201ENST00000462522 306 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL031073.1-201ENST00000503029 1139 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 LINC02428-203ENST00000513793 438 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP52-201ENST00000516219 250 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RNU7-179P-201ENST00000516608 68 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 LINC00967-202ENST00000517725 259 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AP001007.2-201ENST00000525429 593 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 TRAV33-201ENST00000557514 338 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 MIR3137-201ENST00000577367 75 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC009303.2-206ENST00000588042 786 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL137002.1-201ENST00000600642 182 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 C1orf186-209ENST00000603488 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC004852.1-201ENST00000605206 154 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 MIR6745-201ENST00000612694 127 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC245033.3-201ENST00000617986 224 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 FOXP2-201ENST00000350908 2638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP250-201ENST00000362534 119 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 MIR623-201ENST00000384986 98 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 TRAJ24-201ENST00000390513 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 PKMP3-201ENST00000405497 715 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RPL3P8-201ENST00000432928 1191 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC231532.1-201ENST00000438584 312 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL035417.1-201ENST00000442754 214 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC013275.1-202ENST00000457436 501 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC093627.1-201ENST00000465755 877 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RN7SL635P-201ENST00000492123 296 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms