Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 CDY7P-201ENST00000429883 1604 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 EPHA6-204ENST00000502694 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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