Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.8 ms