Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms