Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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TOP3AQ13472 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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TOP3AQ13472 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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TOP3AQ13472 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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TOP3AQ13472 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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TOP3AQ13472 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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TOP3AQ13472 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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TOP3AQ13472 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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TOP3AQ13472 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
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TOP3AQ13472 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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TOP3AQ13472 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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TOP3AQ13472 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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TOP3AQ13472 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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TOP3AQ13472 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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TOP3AQ13472 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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TOP3AQ13472 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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TOP3AQ13472 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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