Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms