Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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PKHD1P08F94 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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PKHD1P08F94 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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PKHD1P08F94 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
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PKHD1P08F94 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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PKHD1P08F94 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
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PKHD1P08F94 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PKHD1P08F94 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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