Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SMG9Q9H0W8 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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