Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TM6SF1Q9BZW5 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms