Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms