Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms